| カード名 | 特殊能力名称 | 分類 |
| ・拡張パック 第１弾 |
| フシギバナ | エナジートランス | POWER |
| リザードン | エナジーバーン | POWER |
| カメックス | あまごい | POWER |
| マルマイン | エネエネ | POWER |
| フーディン | ダメージスワップ | POWER |
| カイリキー | はんげき | BODY |
| ・拡張パック 第２弾「ポケモンジャングル」 |
| ラフレシア | ヒーリング | POWER |
| モルフォン | へんしょく | POWER |
| バリヤード | なぞのかべ | BODY |
| マンキー | スパイ | POWER |
| ドードリオ | にげるサポート | BODY |
| カビゴン | めんえき | BODY |
| ・拡張パック 第３弾「化石の秘密」 |
| ベトベトン | かがくへんかガス | BODY |
| メノクラゲ | おくびょう | POWER |
| オムナイト | おみとおし | BODY |
| ヤドラン | へんなこうどう | POWER |
| ゴースト | とうめい | BODY |
| ゲンガー | のろい | POWER |
| カブト | カブトアーマー | BODY |
| プテラ | げんしのちから | BODY |
| メタモン | へんしん | BODY |
| カイリュー | かけつける | POWER |
| ・拡張パック 第４弾 「ロケット団」 |
| わるいクサイハナ | くさいかふん | POWER |
| わるいベトベトン | ねんちゃくえき | BODY |
| わるいゴルバット | こっそりかみつく | POWER |
| わるいラフレシア | アレルギーかふん | BODY |
| ヒトカゲ | ほのおをもらう | POWER |
| わるいギャラドス | ファイナルビーム | POWER |
| わるいユンゲラー | ぶっしつこうかん | POWER |
| わるいヤドラン | つりあげる | POWER |
| スリープ | えんかくさいみん | POWER |
| わるいダグトリオ | おとしあな | BODY |
| わるいオコリザル | きょうぼう | BODY |
| コラッタ | わるふざけ | POWER |
| わるいハクリュウ | しんかのひかり | POWER |
| わるいカイリュー | てしたをよぶ | POWER |
| ・ジム拡張 第１弾「リーダーズスタジアム」 |
| エリカのマダツボミ | ようぶんきゅうしゅう | POWER |
| エリカのラフレシア | ぼうぎょかふん | BODY |
| エリカのウツボット | かおりのわな | POWER |
| タケシのキュウコン | ばける | POWER |
| R団のファイアー | ふしちょう | POWER |
| カスミのドククラゲ | にげこむ | POWER |
| カスミのギャラドス | はんこう | BODY |
| マチスのレアコイル | エナジーチャージ | POWER |
| タケシのオコリザル | ずらかる | BODY |
| タケシのサイドン | ベンチガード | POWER |
| エリカのミニリュウ | ふしぎなバリアー | BODY |
| ・ジム拡張 第２弾「闇からの挑戦」 |
| エリカのフシギソウ | くつろぎのかおり | BODY |
| キョウのコクーン | うか | POWER |
| キョウのベトベトン | だつりょくえき | BODY |
| カツラのロコン | しぜんになおる | POWER |
| カツラのキュウコン | ほのおでかいふく | BODY |
| ナツメのゴース | ガスのからだ | BODY |
| ナツメのフーディン | サイコリンク | BODY |
| サカキのカイリキー | こんじょう | POWER |
| サカキのペルシアン | ボスをよぶ | POWER |
| イマクニ?のドードー | にげまくる | POWER |
| R団のカビゴン | わるいねぞう | BODY |
| ・ポケモンジム第１弾「ニビシティジム タケシ」 |
| タケシのサイドン | ベンチガード | POWER |
| ・ポケモンジム第１弾「ハナダシティジム カスミ」 |
| カスミのドククラゲ | にげこむ | POWER |
| カスミのパルシェン | シェルアーマー | POWER |
| ・ポケモンジム第２弾「クチバシティジム マチス」 |
| マチスのレアコイル | エナジーチャージ | POWER |
| マチスのマルマイン | ショックボム | BODY |
| ・ポケモンジム第２弾「タマムシティジム エリカ」 |
| エリカのナゾノクサ | こうごうせい | BODY |
| エリカのラフレシア | ぼうぎょかふん | BODY |
| エリカのウツボット | かおりのわな | POWER |
| エリカのミニリュウ | ふしぎなバリアー | BODY |
| ・ポケモンジム第３弾「ヤマブキシティジム ナツメ」 |
| ナツメのフーディン | サイコリンク | BODY |
| ・ポケモンジム第３弾「グレンタウンジム カツラ」 |
| カツラのロコン | しぜんになおる | POWER |
| カツラのキュウコン | ほのおでかいふく | BODY |
| ・拡張シート 第１弾（青版） |
| コクーン | どくのえきたい | BODY |
| トランセル | グリーンシールド | BODY |
| バリヤード | ニュｰトラルダメｰジ | BODY |
| プクリン | てだすけ | POWER |
| カビゴン | とうせんぼ | BODY |
| ・拡張シート 第２弾（赤版） |
| ドガ―ス | ぶんれつ | BODY |
| オムナイト | げんしのゆめ | POWER |
| フリーザー | オーロラヴェール | BODY |
| コイル | マグネット | POWER |
| カブト | かせきか | POWER |
| メタモン | すごいへんしん | POWER |
| ・拡張シート 第３弾（緑版） |
| マタドガス | ポイズミント | POWER |
| オムナイト | かせきのみちびき | POWER |
| スリーパー | にんぎょうつかい | POWER |
| ・ｎｅｏ★拡張パック第１弾「金、銀 新世界へ...」 |
| メガニウム | おいしげる | BODY |
| ヘラクロス | きしかいせい | BODY |
| バクフーン | ファイヤｰリチャｰジ | POWER |
| オーダイル | あばれんぼう | BODY |
| エレキッド | わんぱくパンチ | POWER |
| ランターン | すいりょくはつでん | POWER |
| ヤドキング | ちえくらべ | POWER |
| ヨルノズク | みやぶる | POWER |
| ・ｎｅｏ★拡張パック 第２弾「遺跡をこえて...」 |
| ニョロトノ | かえるのうた | POWER |
| カブト | なかまのふっかつ | POWER |
| アンノーン［Ａ］ | ＡＮＧＥＲ | POWER |
| アンノーン［Ｄ］ | ＤＡＲＫ | BODY |
| アンノーン［Ｆ］ | ＦＩＮＤ | POWER |
| アンノーン［Ｉ］ | ＩＮＣＲＥＡＳＥ | POWER |
| アンノーン［Ｍ］ | ＭＥＴＡＬ | BODY |
| アンノーン［Ｕ］ | ＵＮＤＯ | POWER |
| オムナイト | かせきのふっかつ | POWER |
| ププリン | じっとみる | POWER |
| イーブイ | エナジーしんか | POWER |
| フォレトス | まきびし | BODY |
| ・ｎｅｏ★拡張パック 第３弾「めざめる伝説」 |
| パラセクト | アレルギーほうし | BODY |
| マグカルゴ | やけのこり | BODY |
| エンテイ | おたけび | POWER |
| スイクン | クリスタルボディ | BODY |
| ランターン | せんすい | POWER |
| ライコウ | いなびかり | BODY |
| アンノーン［Ｂ］ | ＢＥＡＲ | POWER |
| アンノーン［Ｋ］ | ＫＥＥＰ | BODY |
| アンノーン［Ｙ］ | ＹＩＥＬＤ | POWER |
| セレビィ | ときわたり | BODY |
| ツボツボ | かたいから | BODY |
| プテラ | げんしのきおく | BODY |
| ポリゴン２ | エナジｰコンバｰタｰ | POWER |
| ハピナス | タマゴうみ | POWER |
| レアコイル | でんじりょく | POWER |
| ・ｎｅｏ★拡張パック 第４弾「闇、そして光へ...」 |
| わるいクロバット | とつぜんかみつく | POWER |
| やさしいウィンディ | おいはらう | POWER |
| わるいマグカルゴ | ヒートプレート | BODY |
| わるいオーダイル | いあつ | BODY |
| やさしいイノムー | ふかふかなからだ | BODY |
| わるいデンリュウ | かんでん | BODY |
| わるいヤドキング | わるぢえ | POWER |
| わるいゲンガー | ふかいねむり | BODY |
| アンノーン［Ｃ］ | ＣＨＡＳＥ | BODY |
| アンノーン［Ｇ］ | ＧＩＶＥ | POWER |
| アンノーン［Ｈ］ | ＨＥＬＰ | POWER |
| アンノーン［Ｌ］ | ＬＡＵＧＨ | POWER |
| アンノーン［Ｐ］ | ＰＥＲＦＯＲＭ | BODY |
| アンノーン［Ｑ］ | ＱＵＩＣＫＥＮ | POWER |
| アンノーン［Ｓ］ | ＳＥＡＲＣＨ | POWER |
| アンノーン［Ｔ］ | ＴＥＬＬ | POWER |
| アンノーン［Ｖ］ | ＶＡＮＩＳＨ | POWER |
| アンノーン［Ｗ］ | ＷＡＮＴ | POWER |
| アンノーン［Ｘ］ | ＸＸＸＸＸ | POWER |
| アンノーン［Ｚ］ | ＺＯＯＭ | BODY |
| やさしいカイリキー | たすけだす | POWER |
| やさしいカイリュー | きせきのかぜ | BODY |
| やさしいトゲチック | おくりもの | POWER |
| わるいポリゴン２ | じくうへんかん | POWER |
| ・プレミアムファイル |
| メガニウム | ハーブのかおり | POWER |
| バクフーン | ファイヤーブースト | POWER |
| オーダイル | どしゃぶり | POWER |
| ・プレミアムファイル・２ |
| リザードン | ファイヤーレイズ | POWER |
| エンテイ | はしりさる | BODY |
| アンノーン［Ｅ］ | ＥＮＧＡＧＥ | POWER |
| アンノーン［Ｎ］ | ＮＯＲＭＡＬ | BODY |
| アンノーン［Ｏ］ | ＯＢＳＥＲＶＥ | POWER |
| ・プレミアムファイル・３ |
| エンテイ | でんせつのからだ | BODY |
| スイクン | でんせつのからだ | BODY |
| ライコウ | でんせつのからだ | BODY |
| ウソッキー | ものまね | BODY |
| ・プロモーションカード |
| わるいフシギソウ | つるでひっぱる | BODY |
| フシギバナ | ソーラーパワー | POWER |
| サカキのニドキング | めいれい | POWER |
| ゲンガー | やみのちから | POWER |
| ミュウ | ニュｰトラルシｰルド | BODY |
| アンノーン［Ｊ］ | ＪＯＩＮ | POWER |
| アンノーン［Ｒ］ | ＲＥＡＳＳＵＲＥ | POWER |
| ＧＲ団のミュウツー | わるいはどう | BODY |
| ダグトリオ | もぐる | BODY |
| イーブイ | れんさしんか | POWER |
| カイリュー | いやしのかぜ | POWER |
| カイリュー | トランスポート | POWER |
| ・ｗｅｂ |
| わるいフシギソウ | つるでひっぱる | BODY |
| わるいユンゲラー | ぶっしつこうかん | POWER |
| わるいヤドラン | つりあげる | POWER |
| ゲンガー | やみのちから | POWER |
| ダグトリオ | もぐる | BODY |
| カイリュー | トランスポート | POWER |